针对您提出的“提交离职单后还能旷工三天自离吗，旷工三天自离会有什么后果”的问题，首先需要明确核心结论。
提交离职单后未完成离职手续前，旷工三天自离可能导致用人单位按规章制度处理。

1. 若用人单位规章制度明确规定“连续旷工3天视为严重违纪”：用人单位可依据《劳动合同法》第三十九条解除劳动合同，且无需支付经济补偿。
2. 若离职单未获批准或未完成工作交接：劳动关系仍存续，旷工可能影响未结算工资（如扣除旷工期间工资），甚至需承担因旷工造成的单位经济损失。
3. 若已完成离职手续（如单位出具解除证明）：旷工行为不影响离职状态，但需确认手续是否合法有效。
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针对您“提交离职单后旷工三天自离”的问题，以下是可能影响处理的特殊情况：
1. 单位未及时审批离职单：若您提交离职单后，单位超过法定或约定时间未审批，您旷工三天的行为可能不被认定为违纪。例如，劳动合同约定离职需提前30天通知，您提交离职单后20天仍未获审批，此时旷工可能被视为合理维权行为。
2. 单位存在违法行为：若单位未依法缴纳社保或拖欠工资，您可依据《劳动合同法》第三十八条立即解除劳动合同，无需提前通知，此时旷工三天可能不承担责任。例如，单位连续3个月未支付工资，您提交离职单后旷工，单位不能以违纪为由解除合同。
3. 双方已协商一致离职：若您与单位口头或书面约定离职时间，即使未完成书面手续，旷工三天也可能不影响离职状态。例如，您与HR约定“提交离职单后一周内办理手续”，一周后您未到岗，单位可能视为已离职。

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